適合理論、計算化學投稿的期刊及其2015年影響因子（2016年公布） 文/Sobereva @北京科音   2016-Jun-14 此文對適合理論、計算化學投稿的期刊進行羅列，并附上2016年6月14日公布的2015年影響因子(IF)。 文中期刊名稱一般用標準縮寫，括號里面是常用簡稱或者全名，之后是ISSN號。斜杠前是2015年的兩年期影響因子（即一般所謂的影響因子），斜杠后是五年期影響因子。有些新刊尚無影響因子數據。...

亂談外重組能的計算 文/Sobereva @北京科音  2016-Jun-8 重組能對Marcus理論計算電子轉移速率很重要，內重組能是大家最關注的，計算方式在此文也談了：《使用Dushin分解重組能和計算Huang-Rhys因子》（http://www.shanxitv.org/330）。外重組能是分子得/失電子或電子態改變后引發環境分子幾何結構弛豫造成的能量變化，其計算關注度低一些，討論其計算方法的文章不多，此文就胡亂對外重組能的計算發表點個人觀點。 和溶液狀態不...

給Ahlrichs的def2系列基組加彌散的方法 文/Sobereva @北京科音 First release: 2016-Jun-8  Last update: 2023-Apr-24   Ahlrichs等人2005年搞的def2系列基組（PCCP,7,3297）如今比較流行，構建得比較理想，比較普適，前六周期完全覆蓋（錒系除外），對于3-zeta級別的版本在同等計算量下精度比Pople系列基組強不少，比Dunnin...

幫助設定Gaussian輸入文件中優化flag和MM電荷的小工具 文/Sobereva @北京科音   2016-Jun-6 近來由于計算需要寫了兩個小程序setopt和setcharge，一個是用來幫助設定Gaussian輸入文件中的優化flag，另一個是幫助設定MM電荷。雖然程序很簡單，但很有用，這里分享下。Windows版及源代碼下載地址： optflag：optflag 1.0.rar setcharge：...

常見的多余的和被濫用的Gaussian關鍵詞 文/sobereva @北京科音 First release: 2016-Jun-5  Last update: 2022-May-28 我平日網上給別人解答無數Gaussian問題，總看到大量初學者的Gaussian輸入文件里的關鍵詞寫得特別污，令我不吐不快。往往越是菜鳥，多余乃至有害的關鍵詞用得越兇，往往還導致自取其辱。這基本都是盲目聽信網...

使用Dushin分解重組能和計算Huang-Rhys因子 文/Sobereva @北京科音  2016-May-30 經常有做電荷轉移的人問怎么用Dushin程序、怎么算重組能、怎么把重組能分解為各個振動模式的貢獻、怎么計算Huang-Rhys因子，本文就結合實例專門說說這些問題。 1 重組能(reorganization energy)的計算 重組能是基于Marcus理論計算電子轉移速率的關鍵的量，具體分為內重組能和外重組能，前者衡量電子得/失后...

傳媒大學第七屆春日舞臺祭雜談和照片 文/Sobereva(2)    2016-May-28 傳媒大學每年都辦春日舞臺祭，類似于當年臨界同人的舞臺演出，有唱歌，有舞蹈，有原創和同人舞臺劇，大部分演員和觀眾都是各個學校的在校本科生。這次第七屆是在2016年5月15日舉行，也是灑家第一次參加這個舞臺祭。整體來說辦得比較成功，時長三個多小時，節目質量整體比較不錯，演員都很賣力，服裝也制作得很精良。活動也得到了Acfun的全面支持，觀看過程中可以發彈幕，會實時...

基于fch中的Hessian矩陣計算振動頻率的簡單程序Hess2freq 文/Sobereva @北京科音  2016-May-27 寫了個教學目的的程序Hess2freq，可以讀取fch中的Hessian矩陣來計算諧振頻率和正則坐標。給了非常易讀的源代碼，而且文檔里把用到的公式和原理都詳細介紹了，對想了解振動分析原理和細節的人應該會很有益。 下載地址：Hess2freq 輸出例子：...

談談隱式溶劑模型下溶解自由能和體系自由能的計算 文/Sobereva @北京科音 First release: 2016-May-24   Last update: 2023-Apr-16 量子化學中，怎么在隱式溶劑模型下計算體系的溶解自由能和體系在溶劑下的自由能是頻繁被問及的問題，其實計算方式非常簡單，但很多人還是沒有搞清楚或認識上有誤區，這里就說說如何正確地計算。首先在第1節...

2016年4月完結動畫簡評 文/Sobereva (2)+(3)  2016-Apr-15 本文是筆者完整觀看過的2016年4月完結的14部全長TV版動畫和9部泡面番/半泡面番的簡評。注意其中多多少少有一些劇透的成份。所有新番筆者都看過前幾話，沒追的要么是筆者對其題材有抗拒（比如恐怖或者胡搞類），要么就是制作質量太差、太低俗、太粗野、內容太老套、太平庸、太莫名其妙等作品自身問題。 按照慣例還是先頒獎，頒獎的作品也都只限于我追...

零食中常見的有害和無害的添加劑 文/Sobereva(3)  2016-Apr-7 很多人總認為吃零食不好，因為感覺里面有防腐劑、色素之類，這完全是誤解！添加劑有有害的也有完全無害的，有些添加劑還是有益的。這里把市面上零食中常見的添加劑按照有害和無害進行分類，平時買零食時候注意先看配料表，若含有有害添加劑的零食盡量不買，只含有無害添加劑的可以放心食用。當然，即便是有害添加劑，在市售零食中肯定也不會超標，偶爾吃吃并無問題，但終究有害...

紀念《Final LoveLive!》北京LL專場音樂會雜談 文/Sobereva(3)    2016-Apr-7 2016年4月3日晚，在北京西區劇場舉辦了《Final LoveLive!》北京LL專場音樂會。這是I DO漫展官方組織的，同一天白天有I DO漫展，不過由于剛從11區回來，灑家沒行動力參加漫展部分。Lovelive的final live想必大家都知道，是μ's的CV小姐姐們最后一次現場liv...

這個是截止到2016年3月14日，使用或引用了Multiwfn程序的總共1010篇文章的全文合集，下載地址：https://pan.baidu.com/s/1GrSLQKOUYmUkQ8-7mH69xw?pwd=b0hs   在Multiwfn主頁(http://www.shanxitv.org/multiwfn)有這些文章的匯總列表和鏈接。由于絕大部分文章都是它們剛在期刊網站上作為ASAP刊登的時候就下載的，所以文檔中一般沒有頁碼、卷號，大家只要到google學術搜索里搜索標...

筆者(Sobereva)近期總結的幻燈片，先將CIS、TDHF、TDDFT和TDA-DFT的形式進行了匯總，并專門對這些方法計算CT激發時隨激發距離R的漸進行為進行了分析討論 /usr/uploads/file/20160215/20160215210232_55711.pdf

PS：鑒于有一些人看完了本文還是覺得操作上吃力，筆者專門錄了個視頻予以演示：https://www.bilibili.com/video/av28653613 在Origin中繪制能量折線圖的方法 文/Sobereva @北京科音   2016-Feb-9 很多討論反應機理的文章都會給出能量折線圖，用于描述反應過程中過渡態、中間體的能量以及連接關系。這種圖中，縱坐標是能量，橫坐標是反應坐標，每個過渡態或中間體在圖中在...