• 使用DORI函數同時考察共價和非共價相互作用

    重要提示:此文介紹的DORI這個函數已經沒有任何使用價值了,強烈不建議使用!在《使用IRI方法圖形化考察化學體系中的化學鍵和弱相互作用》(http://www.shanxitv.org/598)里介紹的筆者提出的IRI方法比DORI定義簡單得多而圖像效果卻好得多,已完全取代了DORI。所以請不要再看DORI這篇文章了,直接看介紹IRI的這篇博文就行了。 使用DORI函數同時考察共價和非共價相互作用 文/Sobereva @北京科音 First release: ...

    2017年4月完結動畫簡評

    2017年4月完結動畫簡評 文/Sobereva  2017-Apr-6 本文是筆者完整觀看過的2017年4月完結的18部全長TV版動畫和4部泡面番的簡評。注意其中多多少少有一些劇透的成份,怕被劇透又想了解哪些值得追的話就看評分就好了。所有新番筆者都看過前幾話,沒追的要么是筆者對其題材有抗拒(比如恐怖或者胡搞類),要么就是制作質量太差、太低俗、太粗野、內容太老套、太平庸、太莫名其妙等作品自身問題。 正在追的還沒完結的有《虎面人W》、《BanG Dream!》和...

    將GROMACS的原子電荷信息讀入VMD的方法

    2023-Jun-8注:推薦用http://bbs.keinsci.com/thread-37839-1-1.html里介紹的VMD載入tpr文件的插件,比本文的做法更方便。VMD載入tpr文件后直接就有了tpr中的原子電荷信息。 將GROMACS的原子電荷信息讀入VMD的方法 文/Sobereva @北京科音 First release: 2017-Mar-27  Last update: 2022-Apr-12 &...

    通過柔性力常數考察鍵的強度

    通過柔性力常數考察鍵的強度 文/Sobereva @北京科音   2017-Mar-1 1 關于鍵強的衡量 鍵的強度是化學研究者十分關心的問題。但鍵的強度不是一個確切的可觀測量,只是一個概念,具體衡量方式多種多樣,常見的有 (1)鍵解離能(BDE) (2)鍵級、AIM理論定義的BCP上的性質 (3)鍵長 (4)鍵方向上的力常數 其中,BDE定義為H(片段1)+H(片段2)-H(整體),這里H指焓,整體和片段結構都是分別優化的。BDE意義很明確,而且...

    使用NWChem做分數占據數的DFT計算

    使用NWChem做分數占據數的DFT計算 文/Sobereva @北京科音   2017-Feb-25 1 前言 分數占據數(Fractional occupation number, FON)計算是指被計算的體系有的軌道占據數不為整數,也因此允許整個體系的電子數不為整數。這看似有點超現實,實際中體系電子數不可能為非整數,畢竟電子不可分割,但對于DFT(或HF)計算是可以實現的,而且在程序實現上超簡單。大家知道,常規DFT計算的時候都是已知電子數,根...

    使用Multiwfn通過LOBA方法計算氧化態

    使用Multiwfn通過LOBA方法計算氧化態 文/Sobereva @北京科音 First release: 2017-Feb-22   Last update: 2019-May-10   1 原理 討論化學體系中的原子,特別是配合物中的金屬的時候經常用到氧化態(oxidation state)這個概念。這是完全人為的概念,不是可觀測...

    談談計算第一超極化率的雙能級公式

    注:后來筆者專門寫了《使用Multiwfn對第一超極化率做雙能級和三能級模型分析》(http://www.shanxitv.org/512),講解怎么通過Multiwfn實現雙能級分析和筆者提出的“三能級分析”,本文讀者必看! 談談計算第一超極化率的雙能級公式 文/Sobereva @北京科音 First release: 2017-Feb-21  Update history: 2019-Aug-6   ...

    2016年優秀動畫音樂推薦

    2016年優秀動畫音樂推薦 文/Sobereva  2017-Feb-16 這是第5次寫“優秀動畫音樂推薦”系列文章,此系列從2014年起不斷發布,之前的見 《2014年上半年優秀動畫音樂推薦》(http://www.shanxitv.org/244) 《2014年下半年優秀動畫音樂推薦》(http://www.shanxitv.org/279) 《2015年上半年優秀動畫音樂推薦》(http://www.shanxitv.org/299) 《2015年下半年優秀動畫音樂推薦》(htt...

    2016年Lovelive!海量精選同人圖合集

    Sobereva無數年前開始就有每日去最大的同人圖網站pixiv(http://www.pixiv.net)掃圖的習慣,早已是雷打不動的每日必做的事情,每天都得花費至少看一話新番的時間去把當日排名至少前350的圖都仔細掃一遍,保存下來精選的。日均收圖60張。 這里筆者將2016年1月1日至2016年12月31日期間從p站上精選的Lovelive!同人圖發在這里,0.99GB。各個角色各種CP都有,總共4331張,包括1600多張sunshine的,下載地址:http://pa...

    2016年度完結動畫總評

    2016年度完結動畫總評 文/Sobereva   2017-Jan-25 此文對筆者完整看過的2016年度完結的101部TV動畫(含24部泡面番)進行總評。劇場版、OVA之類的都沒有納入其中。此文只有“2017年1月完結”部分是新寫的,4月、7月、10月完結的動畫的評論在作品剛完結之時就已經寫好并發在了blog上,在此文只是匯總而已(所以有些文字現在看起來已經out了),不過很多作品的總評分為了保持評價的一致性,在此文又做了微調。前幾年的總評見: 20...

    公共場合使用大字號發言是沒素質的行為

    公共場合使用大字號發言是沒素質的行為 文/Sobereva   2016-Nov-18 筆者常年在思想家公社QQ群里答疑,最反感的情況前三位之一就是發言者用大的字號(其它兩個,是用“好吧”做句子開頭和求sci-hub能下的文獻) 來看典型例子 大字號發言往往一行就頂人家三四、四五行!一次發言就足夠把屏幕全占滿了,往往一屏還顯示不下,造成嚴重刷屏!上面看到的是...

    談談學量子化學如何正確地入門

    PS: 如果你是從零起步的初學者,想入門量子化學,那么恭喜你,看到此文章時,你終于找到正軌了! 談談學量子化學如何正確地入門 文/Sobereva @北京科音 First release: 2016-Nov-12  Last update: 2023-Feb-14           ...

    談談如何又好又快地計算NMR化學位移

    2021-Oct-24重要補充:本文中對泛函選擇的說法已經過時了。后來筆者發現用revTPSS泛函結合pcSseg-1計算NMR相當好而且很便宜,詳見《revTPSS泛函結合pcSseg-1基組是計算NMR很好的選擇》(http://www.shanxitv.org/623),性價比不輸于本文介紹的標度法,精度更明顯強于本文提到的其它方法,如B97-2、KT2、MP2。 談談如何又好又快地計算NMR化學位移 文/Sobereva @北京科音 Fir...

    談談自旋密度、自旋布居以及在Multiwfn中的繪制和計算

    談談自旋密度、自旋布居以及在Multiwfn中的繪制和計算 文/Sobereva @北京科音 First release: 2016-Nov-9    Last update: 2021-Aug-30      自旋密度和自旋布居都是量化里非常重要也很簡單的概念。鑒于很多初學者總是問相關的問題,這里專門說說其概念以及怎么計算。閱讀本文后讀者會充分認識到使用Multiwfn是做自旋密度分析、布居分析的最...

    C3 Beijing 2016 + IDO 19聯展雜談 Part2:所購之物&Cosplay

    此文為雜談第2部分,本文第1部分(現場演出&手辦照片)見http://www.shanxitv.org.com/350 C3 Beijing 2016 + IDO 19聯展雜談 Part2:所購之物&Cosplay 文/Sobereva(3)  2016-Oct-17 C3上銷售攤位不多,以手辦和原版周邊為主,價格普遍比較高。IDO算是綜合性展吧,同人本很難見到,故本子只買了一個。 下面是聯展中買的東西。 經常在B站新番上看到的版權方羚邦的展臺買的...
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