硬盤速度與內存容量對量子化學計算速度影響的測試 文/Sobereva @北京科音   2017-Dec-5 1 前言 本文的目的是通過幾種主流量子化學程序的實測數據，說明量子化學計算用的機子有沒有必要用大內存，有沒有必要用高速硬盤，這倆問題是購買服務器的人很關注的問題。經常有人認為內存容量只要讓計算得以進行就夠了，加大內存對提升速度并沒用處，本文也通過測試看看是否是這么回事。 本文測試用的機子是雙路XEON E5-2696v3（2*18=36個物...

使用Multiwfn+VMD繪制片段貢獻的躍遷偶極矩矢量 文/Sobereva @北京科音 First release: 2017-Dec-2  Last update: 2020-Dec-25 1 前言 躍遷偶極矩是討論電子激發最關鍵的量之一。躍遷偶極矩大，振子強度才可能大，對應的吸收/發射才可能比較強，這些基本知識在此帖都有介紹：《Gaussian中用TDDFT計算激發態和吸收、熒光、磷光光譜的方法》（http://sobereva.c...

在Multiwfn中分析比CCSD更高級別波函數的方法 文/Sobereva @北京科音 First release: 2017-Nov-28  Last update: 2021-May-19       1 前言 Gaussian程序能產生的最高級別的波函數是CCSD，雖然這已經非常精確了，比如在Science, 355, 49 (2017)中作者以CCSD密度為金標準，考察了不同泛函對...

收到給寬叔的《薄暮》動畫募捐的禮品 文/Sobereva 2017-Oct-23 之前聽聞寬叔自己要制作《薄暮》劇場版動畫，展開集資。一度情況比較嚴峻，離截止日不遠了集資才達到目標金額一半多。于是寬叔開始對天朝開放募捐渠道，但是只支持paypal。想到自己paypal還有筆閑錢，amazon也不支持paypal支付而沒什么用處，提現又有點麻煩，就決定捐給這部動畫一部分，總共捐了38000多日元。今日剛剛收到了捐款的禮物。 我是蠻支持寬叔...

2017年10月完結動畫簡評 文/Sobereva  2017-Oct-12 本文是筆者完整觀看過的2017年10月完結的27部全長TV版動畫和5部泡面番的簡評。注意其中多多少少有一些劇透的成份，怕被劇透又想了解哪些值得追的話就看評分就好了。所有新番筆者都看過前幾話，沒追的要么是筆者對其題材有抗拒（比如恐怖或者胡搞類），要么就是制作質量太差、太低俗、太粗野、內容太老套、太平庸、太莫名其妙等作品自身問題。 評分區間是90~95分（低于90分根本不追，超過95的則...

正確認識超線程(HT)技術對計算化學運算的影響 文/Sobereva@北京科音 First release: 2017-Oct-8  Last update: 2022-Oct-4 1 亂談超線程(HT)技術 無數年前就經常看有人在一些討論計算化學的地方鼓吹要在BIOS里關閉超線程(HT)技術，說是會嚴重降低性能。雖然我總在不斷辟謠，避免很多人被以訛傳訛干出關閉HT這樣的傻事情，但是鼓吹關閉HT的言論依然時不時會冒出來。被誤導的人基本...

自行擬合基頻校正因子與ZPE校正因子的簡單方法 文/Sobereva  @北京科音 2017-Oct-6 之前筆者在《談談諧振頻率校正因子》（http://www.shanxitv.org/221）中已經詳細介紹了量子化學中用的頻率校正因子的類型、用法，在《基頻頻率校正因子實際效果測試》（http://www.shanxitv.org/390）中也通過實例展現了頻率校正因子的價值。給出頻率校正因子的文獻和網址甚多，在http://bbs.keinsci.com/foru...

基頻頻率校正因子實際效果測試 文/Sobereva  @北京科音 2017-Oct-5 之前寫過一篇《談談諧振頻率校正因子》（http://www.shanxitv.org/221）專門介紹了量化計算中頻率校正因子的原理、類型和正確的使用方式。在本文中，將通過一系列五花八門的雙原子分子的頻率計算結果和實驗數據的對比，來讓讀者更好地了解頻率校正因子以及非諧振計算的效果。本文不打算做系統性、大規模、嚴謹的全面測試，能以小見大就夠了。 本文選取的一系列分子來自ht...

這個是截止到2017年9月14日，第1011~2001篇使用了Multiwfn程序發表的文章的全文pdf合集，下載地址：http://pan.baidu.com/s/1pLcB1FX 在Multiwfn主頁(http://www.shanxitv.org/multiwfn)有這些文章的匯總列表和鏈接。由于絕大部分文章都是它們剛在期刊網站上作為ASAP刊登的時候就下載的，所以文檔中一般沒有頁碼、卷號，大家只要到google學術搜索里搜索標題一般就能找到文章最終版鏈接。這些文章可以當做Multiwfn...

盤點Grimme迄今對理論化學的貢獻 文/Sobereva  @北京科音 First release: 2017-Sep-3   Last update: 2021-Nov-19 要說理論、計算化學界目前最火的人是誰，如果說是Stefan Grimme教授，恐怕不會招來太多異議（雖然Truhlar、Neese等也很火）。1963年生于德國的Grimme在近十幾年來，對理論計算...

淺談為什么優化和振動分析不需要用大基組 文/Sobereva @北京科音 First release: 2017-Aug-26   Last update: 2023-Jul-31   量化計算中有兩個常識，大部分人想必都知道 (1)優化和振動分析必須在相同級別下進行 (2)在高耗時的優化+振動分析時用中小基組，而只在隨后的單點能計算時才用大基組，這樣做比起所有過程都用大基組耗時大為降低而精度降低很少   其...

2017年7月完結動畫簡評 文/Sobereva  2017-Jul-15 本文是筆者完整觀看過的2017年7月完結的23部全長TV版動畫和3部泡面番的簡評。注意其中多多少少有一些劇透的成份，怕被劇透又想了解哪些值得追的話就看評分就好了。所有新番筆者都看過前幾話，沒追的要么是筆者對其題材有抗拒（比如恐怖或者胡搞類），要么就是制作質量太差、太低俗、太粗野、內容太老套、太平庸、太莫名其妙等作品自身問題。《sin七大罪》由于據說要到7月底才播放最后一話，所以留到10月...

2017年上半年優秀動畫音樂推薦 文/Sobereva  2017-Jul-14 這是第6次寫“優秀動畫音樂推薦”系列文章，此系列從2014年起不斷發布，之前的見 《2016年優秀動畫音樂推薦》（http://www.shanxitv.org/360） 《2015年下半年優秀動畫音樂推薦》（http://www.shanxitv.org/318） 《2015年上半年優秀動畫音樂推薦》（http://www.shanxitv.org/299） 《2014年下半年優秀動畫音樂推薦》（htt...

請到計算化學公社論壇對應的帖子http://bbs.keinsci.com/thread-6310-1-1.html觀看此文，由于圖太多懶得這里再發一次了 寫本文的5年后，在2022年9月末，筆者又購買了新的服務器，是雙路2696v3性能的3.5倍，強烈建議一看：《淘寶上購買的雙路EPYC 7R32 96核服務器的使用感受和雜談》（http://www.shanxitv.org/653）。

使用Multiwfn繪制構象權重平均的光譜 文/Sobereva  @北京科音 First release: 2017-Jun-23  Last update: 2020-Jun-18 1 前言 眾所周知，柔性分子有大量構象，并且其中許多低能的構象在當前研究的溫度下都是有不可忽略的分布比例的，熱平衡狀態時它們的比例通常使用Boltzm...