我看過的所有TV版動畫列表 文/Sobereva First release: 2019-Jul-11   Last update: 2022-Jul-28    之前灑家一直有個習慣，就是每一季動畫完結后，都把下載的動畫刻成DVD，到現在已經刻了800張盤左右了，一共九大包（其中還有大約10%的古老數據是應用程序、PC游戲之類其它亂七八糟的）。考慮到如今大容量移動硬盤已經很便宜了，而刻盤...

2019年上半年觀看的非TV版動畫簡評 文/Sobereva  2019-Jul-7 這是灑家對從2019年1月1日開始截止到2019年6月30日觀看過的非TV版動畫進行的簡單評論。還有些此類動畫看完后忘寫了，就也不再補了。由于這類動畫不好對比和打分，我也就不給出評分了。以往的此系列文章和TV版動畫評論見http://www.shanxitv.org右方的“動畫評論”分類。 肆式青春 類型：劇場動畫 長度：1h14m 此作制作相當不錯...

2022-Jul-5重要補充：本文用的是盆分析方法得到靜電勢極小點的位置和數值，用Multiwfn的拓撲分析功能也實現同樣的目的，而且精度比用盆分析更高。如果你對精度有較高要求，應當用拓撲分析代替盆分析。具體例子參見《使用Multiwfn對靜電勢和范德華勢做拓撲分析精確得到極小點位置和數值》（http://www.shanxitv.org/645）。 繪制靜電勢全局極小點+等值面圖展現孤對電子位置的方法 文/Sobereva@北京科音 ...

適合理論、計算化學投稿的期刊及其2018年影響因子（2019年公布） 文/Sobereva @北京科音  2019-Jun-23 未經授權，不得轉載 1 前言 此文對適合理論、計算化學投稿的期刊進行羅列，并附上2019年6月公布的2018年影響因子(IF)。這正好是第10次筆者寫此系列的文章，往年的文章見本文文末。 文中期刊名稱一般用標準縮寫，括號里面是常用首字母簡稱或者全名，之后是ISSN號。斜杠前是2...

考察分子磁感生電流的程序GIMIC 2.0的使用 文/Sobereva@北京科音 First release: 2019-Jun-22  Last update: 2020-Sep-18 1 前言 GIMIC的主要用途是基于量子化學程序的輸出信息來計算分子的磁感生電流，這對于考察芳香性尤為重要，見《衡量芳香性的方法以及在Multiwfn中的計算》（http://www.shanxitv.org/176）中的相關介紹。GIM...

注：本文內容對應的總是目前Multiwfn官網上最新的版本，不要用老版本Multiwfn 詳談Multiwfn產生ORCA量子化學程序的輸入文件的功能 文/Sobereva@北京科音 First release: 2019-Jun-23  Last update: 2022-Apr-26 1 簡介 ORCA量子化學程序如今的用戶越來越多，用戶數僅次于Gaussian（雖然還有一個數量級的差...

為什么我非常不建議購買和使用阿DF量子化學程序 2019-Jun-2 網上偶爾看見有人問阿DF哪里買，該不該用之類的問題，每次去解釋太麻煩，我這里專門寫一個文章說說我對阿DF的看法。簡單一句話就是：絕對別買阿DF，絕對別用阿DF！ 雖然我并沒怎么親自用過阿DF，也就是以前短暫玩過一把，但我根據我已知的關于阿DF的信息、阿DF手冊以及我的量子化學知識的積累，我不認為此文會有顯著誤導性。雖然可能有不準確的地方，但是我敢打包票95%說的都是正確...

談談該從Gaussian輸出文件中的什么地方讀電子能量 文/Sobereva@北京科音   2019-Jun-1 1 前言 在網上答疑時，經常看到有Gaussian初學者問諸如“我要算xxx，是不是用HF能量”、“我應該用SCF Done能量對比么？”。這種問法被內行人看了很煩，完全是根本沒入門、沒常識的問法，回答他本來想問的問題前還得先給對方科普一下從輸出文件里該讀什么數據。鑒于每次都科普一遍太麻煩、甚至都...

使用Multiwfn和VMD計算分子表面積和片段表面積 文/Sobereva@北京科音  2019-May-27 時常有人問怎么計算分子表面積、怎么計算基團的表面積，其實這用Multiwfn或VMD來做非常簡單，這里就結合例子簡單說一下。 1 關于分子表面的定義 首先要清楚定義表面積的方式非常多，在《談談分子體積的計算》（http://www.shanxitv.org/102）一文中就已經提到了好幾個。其中有一個叫做SASA...

Multiwfn 3.6正式版隆重發布！ 文/Sobereva @北京科音  2019-May-21 Multiwfn的上個正式版3.5是2018年4月16日發布的，經過近一年有余的不斷改進和完善，Multiwfn 3.6正式版終于正式發布！目前已經可以在官網上http://www.shanxitv.org/multiwfn下載。 近一年來Multiwfn更新極度頻繁，帶(dev)后綴的開發版在Multiwfn官網上甚至有時候...

注：軌道權重福井函數/雙描述符特別適合前線軌道簡并或近簡并體系，也是使用本文提到的功能來計算，但本文沒涉及，在另一篇博文里專門作了介紹《通過軌道權重福井函數和軌道權重雙描述符預測親核和親電反應位點》（http://www.shanxitv.org/533），非常建議看過本文后閱讀。 注：本文對應2021-Jul-15及以后更新的Multiwfn及手冊，不要用老版本！ 使用Multiwfn超級方便地計算出概念密度泛函理論中定義的各種量 文/...

在VMD里將cube文件瞬間繪制成效果極佳的等值面圖的方法 文/Sobereva@北京科音  2019-May-21 1 前言 Multiwfn（http://www.shanxitv.org/multiwfn）是產生量子化學研究和波函數分析中用到的各種格點數據最方便也最強大的工具，可以在自帶的界面里直接顯示出等值面，也可以把數據導出成cube文件從而在免費的VMD程序（http://www.ks.uiuc.edu/Research/v...

Simulating UV-Vis and ECD spectra using ORCA and Multiwfn Written by Tian Lu (sobereva@sina.com), 2019-May-20  Beijing Kein Research Center for Natural Sciences (http://www.keinsci.com)  1 Introduction In ...

使用Multiwfn繪制態密度(DOS)圖考察電子結構 文/Sobereva@北京科音 First release: 2019-May-14  Last update: 2023-Jan-28 0 前言 基于主流量子化學程序產生的波函數信息，使用Multiwfn可以對孤立體系非常簡單、快速、靈活地產生質量非常理想的態密度圖，對于分析化學體系的電子結構特征很有幫助。本文將介紹各類態密度圖（Total DOS、Parti...

重要提示：下文是很早以前寫的，如今已經沒意義了！如今使用Multiwfn官網上的最新版本，結合下文提到的xtb產生的molden文件作為輸入文件，直接用《使用Multiwfn+VMD快速地繪制靜電勢著色的分子范德華表面圖和分子間穿透圖》（http://www.shanxitv.org/443）介紹的ESPiso腳本繪制才是最好的做法。因為后來得益于《Multiwfn使用的高效的靜電勢算法的介紹文章已于PCCP期刊發表！》（http://www.shanxitv.org/614）中介紹的Multi...