ANIMANIA圣誕祭感受、照片及演出視頻 Sobereva拍攝于2011年12月17日，寫于2011年12月18日~25日 序：走出演出現場時，已經是11點了，吹著夜晚的風，走在寂寥的街上，只聽得見偶爾沙沙駛過的車輪聲。此刻，感覺渾身上下由內而外的通透，似乎一切疾苦都離我遠去。這個時候已經沒有可用的公共交通工具了，只得打的回家。走進家門后，卸下裝備，感覺似乎還沒完全回到真實，沒有從現場氣氛中自拔，耳朵嗚嗚響，洗手洗臉時就在眼前的流水發出的聲音卻仿佛...

使用Multiwfn作電子密度差圖 文/Sobereva @北京科音 First release: 2011-Dec-24   Last update: 2019-May-22   1 前言 在Multiwfn（http://www.shanxitv.org/multiwfn）里可以十分輕松地作密度差圖，是繪制密度差圖最方便的工具，沒有之一。在程序手冊里也已經給出幾個例子很清楚地介紹了繪制密度差圖...

提取Gaussian的rwf文件信息的工具rwfdump簡介 文/Sobereva @北京科音   2011-Dec-15 Gaussian程序是由一個個獨立的Link子程序組成的，完成一個計算任務需要各種Link按照指定順序和特定選項依次被調用，如同一條作業流水線。在每個Link之間傳遞臨時數據最主要依靠的是rwf文件，即讀寫文件，這個文件在計算任務一開始被初始化，隨著計算的進行，不斷地被填進更多的信息，如果沒有通過%rwf=xxx來指定rw...

次元震蕩ACG展會雜談、戰利品、現場照片和演出視頻 文/Sobereva(3) 2011-Dec-15 次元震蕩ACG展會于2011年12月11日于北京農展館新館舉辦。 先整體評價一下這次展會。實話說，去這次展會前我對這次展會沒報什么期望，因為考慮到這是次元震蕩展會第一次辦，而一周后馬上就在同樣的地點舉辦人氣很高的老牌同人展會ComicDive的第6屆，必定會受到很大沖擊，而且一個月前囧囧有神和ComicVertex大漫展也才結束不很久。我覺得次元震...

PS: 為避免圖片太多造成緩沖太慢，展會的照片單獨貼在另一處，見：http://www.shanxitv.org/109 ComicVertex大漫展雜談及戰利品 文/Sobereva(3)  2011-Dec-4 ComicVertex于2011年11月20日在國家會議中心舉行，由于雜事繁多，收獲也豐富，拖了兩周才寫完此文。 由于是E1、E2聯館，場地是相當的寬敞。10點左右去的，居然不用排隊直接就進，令我吃驚不小，進去...

ComicVertex大漫展現場照片 文/Sobereva(3) 2011-Dec-4 由于避免圖片太多造成緩沖太慢，就把ComicVertex大漫展的雜談+戰利品和現場照片分開發了，以下是現場的照片，雜談+戰利品見http://www.shanxitv.org/110。 這次是我在現場照相照得最多得一次，照了452張 ，篩選出115張能用的。而為了避免圖太多，在這里放出其中70多張。 場地過大而略顯空曠 ...

使用Multiwfn做拓撲分析以及計算孤對電子角度 文/Sobereva @北京科音 First release: 2011-Dec-1 Last update: 2020-Aug-10  波函數分析程序Multiwfn的拓撲分析模塊極為強大、高效、靈活而且普適，原理上可以用于各種實空間函數的拓撲分析，比如電子密度、ELF、LOL、電子密度拉普拉斯函數、軌道波函數等等。電子密度的拓撲分析也是Atoms in molecule...

PS：這是很久以前寫的，里面的內容半數都過時了 回答一些關于Multiwfn的疑問以及未來Multiwfn的發展打算 Multiwfn的開發者Sobereva @北京科音   2011-Nov-13 曾有不少人問我關于Multiwfn的各方面問題，其中比較有普遍性的問題，以及我覺得有可能會有人想問的問題，我在這里統一地回復一下，其中不包括具體操作上的問題。另外，我也打算借這個帖子，用自問自答的形式，透露一下未來Multiwfn的發展打算...

Gaussian中分析振動模式成份的關鍵詞freq=intmodes 文/Sobereva @北京科音   2011-Oct-27 在Gaussian中，在freq關鍵詞中有一個對分析振動模式很有用的選項intmodes，可惜在手冊中對它的描述十分晦澀，導致很多人沒注意到它。這里簡單介紹一下。 freq=intmodes可以把每個簡正振動模式分解為各個冗余內坐標的貢獻。這可以將振動模式的討論定量化，也可以幫助...

GAMESS-US 2011-Aug-11版編譯方法 文/Sobereva @北京科音 First release: 2011-Oct-9 兩年前筆者已經寫過了GAMESS-US的2009 R3版編譯方法，見http://www.shanxitv.org/50。由于在目前最新的2011-Aug-11版中編譯過程發生了一些變化，所以重新寫一遍編譯方法。但這次就不進行那么多解釋了，這樣文章也顯得更清晰整潔。編譯過程的解釋可以參考2009 R3版編譯方法的帖子。官方對...

生成富勒烯的螺旋算法簡介以及使CaGe中的編號與Fowler-Manolopoulos編號相符的方法 文/Sobereva @北京科音   2011-Oct-4 近日有個網友，投了篇富勒烯包夾三金屬氮化物的文章。她用的富勒烯是CaGe生成的，編號用的是CaGe生成時的順序。然而審稿人要求必須使編號規則滿足IUPAC推薦的編號規則，即Fowler-Manolopoulos編號系統。經過探索，現在筆者已找到辦法讓CaGe的編號順序和F...

PS: 由于Amber11編譯時是在Linux下面一邊編譯一邊寫的，又沒裝中文輸入法，所以就寫成英文了。Amber12安裝方法只是很簡單地寫了下。 Amber11+AmberTools1.5及CUDA版安裝方法，以及Amber12安裝方法 文/Sobereva @北京科音 First release: 2011-Sep-23  Last update: 2014-Aug-21 =============== Amber11安裝方法 =====...

談談分子體積的計算  文/Sobereva @北京科音 First release: 2011-Sep-20  Last update: 2022-Jan-14 我曾在網上數次看到有人問怎么算分子體積，從提問以及很多人的回答上看有不少人對這問題存在錯誤的認識，本文就來談談這個問題，既會說明基本原理，也會說明怎么具體計算。本文用到的Multiwfn程序可以在http://www.shanxitv.org/multiwfn免費...

AM3動漫同人演唱會全紀錄 文/Sobereva(3)   2011-Sep-19 ANIMANIA動漫音樂社團已經搞了數次同人演唱會了，這次是我第一次去，簡稱AM3。詳情見http://www.anisongmania.com/twinkle_beijing/index.html。在麻雀瓦舍小劇場里。演出在下午2:00開始，共4個多小時，上午是很mini的暖場漫展（30個左右攤位）。票價35。 站了9個多小時，沒吃沒...

做了些紙模 文/Sobereva   2011-Aug-29 我小時候喜歡做紙模，前一陣子重新拾起這個興趣，淘寶上買了一些打印好圖案的硬紙，趁閑暇做了一些。果然我至今對制作紙模還是充滿了興趣。 這是我制作時用的全部工具。用剪子去剪通常不如用刀筆去刻方面，剪出來的線條不容易直，而且在鏤空處就不可能用剪子了。刻的時候必須用墊板，最好用這種專用的，對刀鋒磨損小，刻的時候不容易打滑，而且在墊板上基本看不出刻過的痕跡，可反復使用。膠水比較有講究...