Date: June 7, 2015
Category: 量子化學
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2023-Jun-3注:筆者后來又寫了《基于Gaussian的NMR=CSGT任務得到各個軌道對NICS貢獻的方法》(http://www.shanxitv.org/670)介紹另一種分解NICS的方法,可以得到各個分子軌道的貢獻,只需要用Gaussian而不依賴于NBO
將核獨立化學位移(NICS)分解為sigma和pi軌道的貢獻
文/Sobereva @北京科音
First release: 2012-May-31 Las...
編譯NBO5.0獨立運行版和嵌入Gaussian03 C02版的方法
文/Sobereva @北京科音 2012-May-30
NBO程序有兩種運行模式,一種是獨立運行版,稱GENNBO,也叫standalone版。一種是作為模塊嵌入進其它大型量子化學程序的版本,稱ESS(electronic structure system)版NBO,例如Gaussian的l607模塊就是其免費的3.1版。ESS版可以實現更多功能...
Date: June 7, 2015
Category: 分子模擬
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將Material Studio的xtd軌跡文件導出為xyz軌跡文件的方法
文/Sobereva @北京科音 First release: 2012-May-23
Material Studio(MS)的xtd文件包含了原子或者粗粒化模擬中的bead的軌跡信息。這是MS的私有格式,為了能將軌跡放到其它程序,比如VMD中做更靈活細致的分析,需要轉換為通用軌跡格式。xtd文件內含的實際軌跡信息實際上儲存在同目錄下的同名的.trj隱藏...
Date: June 7, 2015
Category: 二次元
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幻想鄉開放日雜談和現場演出錄像
文/Sobereva(3) 2012-May-21
先不說別的,看一段這次幻想鄉開放日的現場演出視頻吧,東方眾熟知的《全人類ノ非想天則》和《幻想萬華鏡》的神級sax演出,真心覺得碉堡!這位形似土狼的大叔我已經在五花八門的漫展上見過N次,但這回,我才知道此人真乃人才!
幻想鄉開放日于2012年5月20日在帝都朝陽區東三環三元西橋曙光里小學貝特羽毛球館舉行,是去年次元震蕩漫展的那批人辦的。此漫展主題還是有一定創意的,也就...
Date: June 7, 2015
Category: 二次元
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Fate/Zero百合文:Equilateral triangle
文/Sobereva 2012-May-20
一 舞彌與愛麗絲菲爾
我,久宇舞彌,從小被當做一個武器和泄欲的工具被養大,組成我生命的只有殺戮和痛苦的煎熬。直到衛宮切嗣將我救出的那一天開始,我仿佛才第一次有了意識和情感。
愛麗絲菲爾是為了圣杯戰爭而通過魔術制造的人偶,她表面上與人類沒有任何不同,名義上是切嗣的夫人。每當愛麗絲菲爾單獨出行時,切嗣總是讓...
Date: June 7, 2015
Category: 二次元
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第5屆臨界同人漫展收獲和cosplay照片
文/Sobereva(3) 2012-May-13
第5屆臨界同人漫展于2012年5月13日在中國人民大學籃球場舉行。這回臨界同人與往屆最大的不同,應該就是沒有專門的cosplay演出了,只有漫展部分。話說,第4屆的演出徹底搞砸了,要是早知那樣我都不去了。而這次取消據說是因為人大的場館由于涉及到某些違規,暫時沒法正常使用所致。希望下一屆還能恢復,這種綜合性的cosplay演出也算是臨界同人最大的特色...
Date: June 7, 2015
Category: 二次元
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存在感最低的漫展--GTV“lim2.5 D”夏日學園祭游記
文/Sobereva(3) 2012-May-7
lim2.5D漫展于2012年5月6日在北京朝陽傳媒影視技術服務中心一層舉辦。這個漫展是我去過的,最最坑爹的漫展,沒有之一。展館位置實在是太隱蔽了,在官方頁面說的大黃莊下了公交車,頂著烈日在附近來回走了一個多小時才終于找到場館!一度令我以為這個漫展是不是臨時取消了,畢竟這漫展不收門票錢也不收攤位費,而且是第一次辦,地點很不知名,臨開展差不多一個...
后記:Multiwfn從3.4版開始支持了軌道定域化功能,如果沒有離域范圍很大的AdNDP軌道時可以直接代替AdNDP分析,結果基本相同,但用起來方便得多,詳見《Multiwfn的軌道定域化功能的使用以及與NBO、AdNDP分析的對比》(http://www.shanxitv.org/380)。
使用AdNDP方法以及ELF/LOL、多中心鍵級研究多中心鍵
文/Sobereva @北京科音
First release: 2012-May-8...
Date: June 7, 2015
Category: 量子化學
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2019-Mar-3注:在文末補充了全新的測試,以反映目前主流硬件下的情況
首個完全基于GPU的量化軟件-TeraChem雜談及真實性能測試
文/Sobereva 2012-Apr-30
TeraChem是第一個公布于世的、完全基于GPU運算的從頭算量化程序,2010年5月發布第一版。雖然很早就聽說過此程序,但直到近日才終于有機會親自把玩,此文將雜談此程序的一些特征,并且實際測試一下此程序的性能,看看到...
重要提示:此文已經完全過時了,不要再看。讀者務必看筆者后來寫的《使用Multiwfn繪制躍遷密度矩陣和電荷轉移矩陣考察電子激發特征》(http://www.shanxitv.org/436)
繪制躍遷密度矩陣平面圖分析電子躍遷
文/Sobereva @北京科音
First release: 2012-Apr-9 Last update: 2018-Jun-10
1 原理
已知兩個電子態G、E的波函數,就可...
Date: June 7, 2015
Category: 二次元
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賊船漫展雜談、照片和現場演唱/舞蹈錄像
文/Sobereva(3) 2012-Apr-7
賊船漫展于2012年4月2日、3日在國家奧林匹克森林公園羽毛球館舉行。寡人去的是4月2日的。這個漫展屬于小規模的,只有2500平米、120個攤位(約大型漫展的1/3),和CP3 beta屬于一個級別。在這種小場地進行總是造成在接近12點前后的人流高峰期館內極為擁擠、燥熱,而且照相頗不方便,此次也是。
門票20,沒有預售票,只有現場票。前X...
使用Multiwfn繪制NBO及相關軌道
文/Sobereva @北京科音
First release: 2012-Apr-4 Last update: 2018-May-24
1 前言
NBO程序輸出的軌道包括NBO(自然鍵軌道)、NHO(自然雜化軌道)、NAO(自然原子軌道)、NLMO(自然定域化分子軌道),以及前頭帶P的類型,如PNBO(初自然鍵軌道)。NBO程序輸出的plot文件包含了...
Date: June 7, 2015
Category: 二次元
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初音與靈夢的百合會2演唱會雜談、照片及錄像
文/Sobereva(3) 2012-Mar-27
初音與靈夢的百合會2北京場是寡人第三次參加的ANIMANIA社團的演唱會,于2012年3月25日在麻雀瓦舍進行,票價40,上半場是10:00~12:00。下半場是13:00~16:00(實際結束時間17:00出頭)。
看完之后,我懷帶著歡樂的心情和腰疼,在坐公交車回家的路上,頭腦里冒出一個詭異、看似頗不搭調的想法:如果前不久剛跳樓自殺的...
印了件Multiwfn的T恤
文/Sobereva
一直想印個Multiwfn的T恤,以借開會之機給Multiwfn打打隱性廣告,猶豫、比較了很久,在http://love3.taobao.com上
定制了一件Multiwfn
logo的T恤。只要提供圖片文件就能印。用的是熱轉印方式,印刷質量非常完美,沒有絲毫偏色,色彩過渡細膩,看不出色階,基本沒有串入其它任何色點,衣服穿著也挺舒服。而且免費做出了鏤空效果,也就是圖片的黑色底色區域不被印...
注:本文屬于深入、詳細的討論。如果只是著急想馬上得到軌道成分計算結果,直接看本文第6節或Multiwfn手冊的4.8節的例子即可。
談談軌道成份的計算方法
文/Sobereva @北京科音
First release: 2012-Feb-24 Last update: 2020-Jun-3
1 前言
經常有人發帖問怎么計算軌道成份,文獻中也經常給出軌道成份,用于討論電子結...
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