GAPT電荷的原理和性質 文/Sobereva @北京科音   2013-11-5   在《物理化學學報》上有一篇《原子電荷計算方法的對比》（2012, 28, 1-18，http://www.whxb.pku.edu.cn/CN/abstract/abstract27818.shtml），簡要介紹并詳細比較了諸多常用計算原子電荷的方法。但由于篇幅所限，再加上GAPT電荷沒什么實用價值，文中沒有對GA...

注：強烈建議讀者先閱讀筆者后來寫的《使用Multiwfn+VMD快速地繪制高質量AIM拓撲分析圖》（http://www.shanxitv.org/445），其中將本文的操作過程通過腳本極大地簡化，只需要不到1/20的時間就可以繪制出本文相同效果的圖像。 Multiwfn結合VMD繪制AIM拓撲分析圖 文/Sobereva @北京科音 First release: 2013-Nov-5  Last update: 2018-Feb-27 ...

IDO5×臨界6.5 cosplay照片 攝影/Sobereva(3)  2013-Oct-16 有個面善的蜀黎一直拿著制造泡泡的機器，泡泡起來，意境一下子就出來了。這照片寡人挺滿意的 很有氣魄的戰錘的盔甲 眾人對其真身是否是妹子表示嚴重懷疑 亞里亞 表情非常自然 顯得很有自信的涼宮 ...

IDO5×臨界6.5雜談、演出錄像和收獲 文/Sobereva(3)  2013-Oct-16 IDO5×臨界6.5在2013年10月3日于國家會議中心舉行。這次漫展比較特殊，10月2日是純粹的IDO5，而寡人去的3號則是IDO5和臨界同人6.5共同的展場，這是我所見到的第一次有兩個漫展一起搞。今年暑期的臨界同人6據說是因為人大籃球場施工所以泡湯了，所以很遺憾沒辦成，想不到這回會和IDO5合伙。我覺得大抵是IDO5有錢但人氣不比臨界，而臨界...

2013年10月完結動畫簡評 文/Sobereva  2013-Oct-11 還是按照慣例，每隔一個季度簡評一下筆者完整看過的剛完結的動畫，此文包含27部作品。 最佳音樂獎：薔薇少女 新作，宇宙戰艦大和號2199 TV 優秀音樂獎：有你的小鎮，空之境界TV 最佳女CV：橘田泉（黑木智子-喪女），花澤香菜（黑貓-俺妹2） 優秀女CV：竹達彩奈（沢渡楓-玉響2、桐乃-俺妹2），新井里美（黑子-超科學的電磁炮S），阿澄佳奈（...

淺談VSCF求解分子振動問題 文/Sobereva @北京科音  2013-Oct-2 在BO近似下，電子的運動與核運動完全分離開，而不必直接求解電子+核波函數。原子核可以當做是在絕熱勢能面上運動。在這樣的勢場下求解原子核的薛定諤方程，就能得到不同振動能級對應的核波函數（對于此文的范疇，具體稱為振動波函數）和振動能量。振動基態與第一振動激發態的能量差對應的是基頻（fundamental）；振動基態到更高振動激發態的吸收頻率就是泛音帶（overtune ...

研究波函數分析的主要人物一覽 文/Sobereva @北京科音 First release: 2013-Sep-28   Last update: 2023-Jul-19 很多人對波函數分析十分陌生，誤以為是個極為小眾向的領域，導致本人時常被問及當今研究波函數分析的主要人物都有哪些。實際上做波函數分析的人數相當巨大。在此做一個簡要的、不完整的匯總。主要研究內容和成果都寫在上面了。雖然有些人曾經也提出了很有意義的波函數分析...

Multiwfn 2013年暑期培訓班感想與雜談 文/Sobereva   2013-Sep-17 在2013年8月13日至15日，在北京科技大學召開了第一屆波函數分析暨Multiwfn培訓班，此文就隨便、沒有條理地談談此次培訓班的感想以及展望。 此次培訓班全部所用的幻燈片，包括現場演示的一些動畫可以在此處下載http://pan.baidu.com/share/link?shareid=759751855&uk=...

通過鍵級曲線和ELF/LOL/RDG等值面動畫研究化學反應過程 文/Sobereva @北京科音  2013-Sep-11 很久很久以前，寡人寫過一篇帖子名為《制作動畫分析電子結構特征》（http://www.shanxitv.org/86）。在此帖中筆者介紹了怎么制作動畫研究IRC、SCAN過程中電子結構的變化。本文算是對那篇文章的進一步擴展。這里將介紹怎么利用Multiwfn (http://www.shanxitv.org/multiwfn...

產生Gaussian的IRC和SCAN任務每個點的波函數文件的工具：IRCsplit和SCANsplit 文/Sobereva @北京科音 First release: 2013-Sep-9   Last update: 2019-Mar-21 將Gaussian產生的IRC路徑或SCAN任務（特指剛性掃描，后同）當中每個點的波函數文件導出，從而通過Multiwfn等程序進行分析，對于研究反應過程中電子結構的變化是十分有益...

在布達佩斯拍的一點照片 文/Sobereva  2013-Sep-3   去Budapest參加ISTCP-VIII (http://coulson.chem.elte.hu/istcp8/)，不是去玩，所以本來也沒打算拍照。又嫌帶著麻煩、行李箱放不下，就沒帶著NEX-5R。但是還是忍不住拿MI2拍了點兒景。沒法指望手機能拍出什么好效果，湊合看吧。 話說ISTCP-VIII真是大牌云集，楊偉濤、Gill、Be...

在VMD中顯示原子序號的方法 文/Sobereva First release: 2013-Jul-30    Last update: 2014-Jul-23 VMD雖然靈活強大，但是卻沒有提供一般的分子可視化軟件的直接顯示全部原子序號的功能，比較不方便。但是這也可以手動或者通過腳本來實現。 手動實現的辦法就是按數字鍵1，然后依次點擊打算顯示原子編號的原子，然后進入Graphics-Labels，選中所有條目，然后點擊Properties...

注：筆者后來又寫了《使用Multiwfn+VMD快速地繪制靜電勢著色的分子范德華表面圖和分子間穿透圖》（http://www.shanxitv.org/443），是繪制分子表面靜電勢圖最完美的解決方案。其中通過腳本，把此文的繪制標準靜電勢填色的范德華表面圖的步驟簡化到了極致，只需要用不到本文1/10的步驟和耗時就可以達到比本文更好的效果，而且完全避免了用戶對VMD操作不熟導致畫不出來圖。強烈建議讀者先閱讀443這篇文章后再讀本文，兩篇文章有互補性。 使用Mult...

宇宙學模擬程序GADGET 2.0.7安裝方法 文/Sobereva @北京科音  2013-Jul-25 GADGET-2 (GAlaxies with Dark matter and Gas intEracT)是一個極為流行的宇宙學模擬程序，地位大抵類似于量子化學中的Gaussian（貌似），原文見Mon. Not. R. Astron. Soc. 364, 1105–1134 (2005)。它基于多體方法和光滑粒子流體動力學(smoothed particl...

2013年7月完結動畫簡評 文/Sobereva  2013-Jul-4 季度頒獎： 最佳OP：革命機Valvrave，麻雀酒店，潛行吧！奈亞子W 優秀OP：悠悠式，DD北斗神拳，惡之華 最佳ED：革命機Valvrave，惡之華，潛行吧！奈亞子W 優秀ED：AIURA，打工吧！魔王大人，惡魔幸存者2 最佳女主角：仲村佐和（惡之華），奈亞子（潛行吧！奈亞子W） 優秀女主角：綾瀨千早（花牌情緣2），齋楓（獨眼巨人少女齋楓...