• 使用Multiwfn計算(超)極化率密度

    2019-Aug-24補充:本文介紹的是考察某個笛卡爾軸方向的(超)極化率密度,如果你想考察體系偶極矩方向的(超)極化率密度,最好先旋轉體系使得偶極矩平行于某個笛卡爾坐標軸,具體做法見《讓體系(躍遷)偶極矩平行于某個笛卡爾軸的方法》(http://www.shanxitv.org/507)。 重要提示:后來寫的《使用Multiwfn極為方便地繪制(超)極化率密度和三維空間對(超)極化率的貢獻》(http://www.shanxitv.org/683)介紹了Multiwfn于2023-...

    μ's Best album-Best Live! Collection II開箱圖賞

    μ's Best album-Best Live! Collection II開箱圖賞 文/Sobereva(3)  2015-Sep-6 rp爆發,在2015年9月5日的ANIMANIA偶像專場演出中抽著了大獎μ's Best album-Best Live Collection II,這就開苞給大家看看。我細心把玩后就一句話:官方還敢更良心么? 盒子很大,還挺沉,外觀挺漂亮 把盒子上蓋打開,可以看到四周有很漂亮的角色圖,設...

    計算兩個平面夾角的小程序

    2021-Mar-3補充:后來在Multiwfn里加入了對動力學軌跡計算指定的兩個平面間夾角隨幀號變化的功能,見《計算分子動力學軌跡中兩個環平面間的距離和夾角》(http://www.shanxitv.org/590)。 今天思想家公社QQ群有人問怎么計算兩個平面的夾角。如果本身是二面角好辦直接量就行了,但如果不屬于這種情況就稍微麻煩,雖然有一些可視化程序如diamond可以量但終究為這點事安裝一個也麻煩。這里提供個自寫...

    2015年上半年優秀動畫音樂推薦

    2015年上半年優秀動畫音樂推薦 文/Sobereva(3)   2015-Jul-15 這是第3次寫“優秀動畫音樂推薦”系列文章,此系列從2014年起每半年發一次,前兩次見 《2014年上半年優秀動畫音樂推薦》(http://www.shanxitv.org/244) 《2014年下半年優秀動畫音樂推薦》(http://www.shanxitv.org/279) 不管動畫是否追了,所有新番的OST、OP/ED、歌曲集、角色集什么的一切衍生的音樂...

    2015年7月完結動畫簡評

    2015年7月完結動畫簡評 文/Sobereva (2)+(3)  2015-Jul-8 本文是筆者完整觀看過的2015年7月完結的16部TV版動畫(包含6部泡面番)的簡評。注意其中多多少少有一些劇透的成份。所有新番筆者都看過前幾話,沒追的要么是筆者對其題材有抗拒(比如恐怖或者胡搞類),要么就是制作質量太差、太低俗、太粗野、內容太老套、太平庸、太莫名其妙等作品自身問題。 按照慣例還是先頒獎,頒獎的作品也都只限于我追下來的。 ...

    2015年4月完結動畫簡評

    PS:四月初太忙沒來寫,于是和7月完結動畫簡評一起發了 2015年4月完結動畫簡評 文/Sobereva (2)+(3)   2015-Jul-8   本文是筆者完整觀看過的2015年4月完結的20部TV版動畫(包含2部泡面番)的簡評。注意其中多多少少有一些劇透的成份。所有新番筆者都看過前幾話,沒追的要么是筆者對其題材有抗拒(比如恐怖或者胡搞類),要么就是制作質量太差、太低俗、太粗野、內容太老套...

    計算化學中的一些常見不良寫法和用詞

    計算化學中的一些常見不良寫法和用詞 文/Sobereva @北京科音 First release:2015-Jun-28   Last update:2023-Jun-13 經常在看一些文章、帖子,以及回答一些人的問題的時候,看到很多詞匯誤用和不良寫法,令寡人不悅。在這里就舉一些最典型的說說。有的地方其實也只是個人發發牢騷而已。 1 NBO電荷應當叫做NPA電荷 很多文章里都用“NBO電荷”來代表NBO程...

    談談Gaussian中的對稱性與nosymm關鍵詞的使用

    談談Gaussian中的對稱性與nosymm關鍵詞的使用 文/Sobereva @北京科音 First release: 2015-Jun-27   Last update: 2021-Nov-21 經常有人問Gaussian中的nosymm關鍵詞怎么用、什么時候用,網上也有很多帖子、資料都涉及nosymm,但是很多都明顯錯誤,誤人子弟。還有很多人亂用nosymm,不僅沒什么意義還白浪費了大量時間。故寫此文澄清一下nosymm...

    適合理論、計算化學投稿的期刊及其2014年影響因子(2015年公布)

    適合理論、計算化學投稿的期刊及其2014年影響因子(2015年公布) 文/Sobereva @北京科音   2015-Jun-20 此文對適合理論、計算化學投稿的期刊進行羅列,并附上2015年公布的2014年影響因子(IF)。 文中期刊名稱一般用標準縮寫,括號里面是常用簡稱或者全名,之后是ISSN號。斜杠前是2014年的兩年期影響因子(即一般所謂的影響因子),斜杠后是五年期影響因子。有些新刊尚無影響因子數據。多數情況期...

    使用AICD 2.0繪制磁感應電流圖

    使用AICD 2.0繪制磁感應電流圖 文/Sobereva @北京科音 First release: 2015-Jun-13  Last update: 2021-Jul-7 以前寫過一篇帖子《使用AICD程序研究電子離域性和磁感應電流密度》(http://www.shanxitv.org/147),那個帖子當時用的是1.5.7.1版。AICD本身用起來簡單,但是使用前必須自行編譯高斯,這使得絕大部分用戶都無緣使用AICD。好在從Ga...

    幻燈片:Multiwfn與波函數分析簡介(2019版)

    這是簡略介紹波函數分析的一些基本概念和Multiwfn程序基本情況的一個幻燈片,300多頁,如果對波函數分析和Multiwfn完全不了解,看看此幻燈片將十分有益,會明白波函數分析的重要性有多大。這個幻燈片可能每一兩年更新一次。 下載地址:Multiwfn官網(http://www.shanxitv.org/multiwfn)的Resources頁面里的 "A brief introduction to Multiwfn and wavefunction analysis" 如...

    GaussView保存輸入文件時內坐標變量不用字母表示的解決方法

    GaussView保存輸入文件時內坐標變量不用字母表示的解決方法 文/Sobereva @北京科音 First release: 2015-Feb-2   Last update: 2021-Jul-9 今天在思想家公社QQ群里有人問GaussView保存Gaussian輸入文件時,在保存界面中取消了write cartesian選項以保存成內坐標形式,但是保存出來的內坐標的變量直接用數字表示,如下面這樣,...

    用Multiwfn+VMD做RDG分析時的一些要點和常見問題

    用Multiwfn+VMD做RDG分析時的一些要點和常見問題 文/Sobereva @北京科音 First release: 2015-Jun-2  Last update: 2022-Mar-8 用Multiwfn (http://www.shanxitv.org/multiwfn)結合VMD繪制RDG填色等值面圖是研究弱相互作用的必不可少的法寶,廣為流行,詳見《使用Multiwfn圖形化研究弱相互作用》(http://so...

    在VMD中計算RMSD衡量兩個結構間的幾何偏差

    在VMD中計算RMSD衡量兩個結構間的差異以及疊合兩個結構 文/Sobereva@北京科音 First release: 2015-May-11  Last update: 2020-Feb-25 1 原理 RMSD(Root mean square displacement/deviation)搞分子模擬的人都很熟悉,但是搞量子化學的人可能好多都不知道。有人問怎么衡量激發態結構相對于基態的改變,雖然可以挨個比較鍵長鍵角的變化,但...
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