考察分子磁感生電流的程序GIMIC 2.0的使用 文/Sobereva@北京科音 First release: 2019-Jun-22  Last update: 2020-Sep-18 1 前言 GIMIC的主要用途是基于量子化學程序的輸出信息來計算分子的磁感生電流，這對于考察芳香性尤為重要，見《衡量芳香性的方法以及在Multiwfn中的計算》（http://www.shanxitv.org/176）中的相關介紹。GIM...

注：本文內容對應的總是目前Multiwfn官網上最新的版本，不要用老版本Multiwfn 詳談Multiwfn產生ORCA量子化學程序的輸入文件的功能 文/Sobereva@北京科音 First release: 2019-Jun-23  Last update: 2022-Apr-26 1 簡介 ORCA量子化學程序如今的用戶越來越多，用戶數僅次于Gaussian（雖然還有一個數量級的差...

為什么我非常不建議購買和使用阿DF量子化學程序 2019-Jun-2 網上偶爾看見有人問阿DF哪里買，該不該用之類的問題，每次去解釋太麻煩，我這里專門寫一個文章說說我對阿DF的看法。簡單一句話就是：絕對別買阿DF，絕對別用阿DF！ 雖然我并沒怎么親自用過阿DF，也就是以前短暫玩過一把，但我根據我已知的關于阿DF的信息、阿DF手冊以及我的量子化學知識的積累，我不認為此文會有顯著誤導性。雖然可能有不準確的地方，但是我敢打包票95%說的都是正確...

談談該從Gaussian輸出文件中的什么地方讀電子能量 文/Sobereva@北京科音 First release: 2019-Jun-1    Last update: 2023-Sep-16 1 前言 在網上答疑時，經常看到有Gaussian初學者問諸如“我要算xxx，是不是用HF能量”、“我應該用SCF Done能量對比么？”。這種問法被內行人看了很煩，完全是根本沒入門、沒常識的問法...

使用Multiwfn和VMD計算分子表面積和片段表面積 文/Sobereva@北京科音  2019-May-27 時常有人問怎么計算分子表面積、怎么計算基團的表面積，其實這用Multiwfn或VMD來做非常簡單，這里就結合例子簡單說一下。 1 關于分子表面的定義 首先要清楚定義表面積的方式非常多，在《談談分子體積的計算》（http://www.shanxitv.org/102）一文中就已經提到了好幾個。其中有一個叫做SASA...

Multiwfn 3.6正式版隆重發布！ 文/Sobereva @北京科音  2019-May-21 Multiwfn的上個正式版3.5是2018年4月16日發布的，經過近一年有余的不斷改進和完善，Multiwfn 3.6正式版終于正式發布！目前已經可以在官網上http://www.shanxitv.org/multiwfn下載。 近一年來Multiwfn更新極度頻繁，帶(dev)后綴的開發版在Multiwfn官網上甚至有時候...

注：軌道權重福井函數/雙描述符特別適合前線軌道簡并或近簡并體系，也是使用本文提到的功能來計算，但本文沒涉及，在另一篇博文里專門作了介紹《通過軌道權重福井函數和軌道權重雙描述符預測親核和親電反應位點》（http://www.shanxitv.org/533），非常建議看過本文后閱讀。 注：本文對應2021-Jul-15及以后更新的Multiwfn及手冊，不要用老版本！ 使用Multiwfn超級方便地計算出概念密度泛函理論中定義的各種量 文/...

在VMD里將cube文件瞬間繪制成效果極佳的等值面圖的方法 文/Sobereva@北京科音  2019-May-21 1 前言 Multiwfn（http://www.shanxitv.org/multiwfn）是產生量子化學研究和波函數分析中用到的各種格點數據最方便也最強大的工具，可以在自帶的界面里直接顯示出等值面，也可以把數據導出成cube文件從而在免費的VMD程序（http://www.ks.uiuc.edu/Research/v...

Simulating UV-Vis and ECD spectra using ORCA and Multiwfn Written by Tian Lu (sobereva@sina.com), 2019-May-20  Beijing Kein Research Center for Natural Sciences (http://www.keinsci.com)  1 Introduction In ...

使用Multiwfn繪制態密度(DOS)圖考察電子結構 文/Sobereva@北京科音 First release: 2019-May-14  Last update: 2023-Jan-28 0 前言 基于主流量子化學程序產生的波函數信息，使用Multiwfn可以對孤立體系非常簡單、快速、靈活地產生質量非常理想的態密度圖，對于分析化學體系的電子結構特征很有幫助。本文將介紹各類態密度圖（Total DOS、Parti...

重要提示：下文是很早以前寫的，如今已經沒意義了！如今使用Multiwfn官網上的最新版本，結合下文提到的xtb產生的molden文件作為輸入文件，直接用《使用Multiwfn+VMD快速地繪制靜電勢著色的分子范德華表面圖和分子間穿透圖》（http://www.shanxitv.org/443）介紹的ESPiso腳本繪制才是最好的做法。因為后來得益于《Multiwfn使用的高效的靜電勢算法的介紹文章已于PCCP期刊發表！》（http://www.shanxitv.org/614）中介紹的Multi...

2019年4月完結動畫簡評 文/Sobereva  2019-May-2 本文是筆者完整觀看過的2019年4月完結的24部全長TV版動畫和6部泡面番的簡評。注意其中多多少少有一些劇透的成份，怕被劇透又想了解哪些值得追的話就看評分就好了。所有新番筆者都看過前幾話（掃番過程的粗略觀感在http://bbs.keinsci.com/forum-68-1.html里的相應帖子里寫了），沒追的要么是筆者對其題材有抗拒（比如恐怖或者胡搞類），要么就是由...

本文配有操作演示視頻，強烈建議一看：https://www.bilibili.com/video/av50818216 使用Multiwfn一鍵批量產生各類光譜圖 文/Sobereva@北京科音  2019-Apr-29 0 前言 ...

使用Multiwfn繪制光電子譜 文/Sobereva@北京科音 First release: 2019-Apr-27  Last update: 2020-Sep-28 1 前言 波函數分析程序Multiwfn（http://www.shanxitv.org/multiwfn）具有很方便、靈活、強大的態密度(DOS)繪制功能，在《使用Multiwfn繪制態密度(DOS)圖考察電子結構》（http://sobereva.c...

談談記錄化學體系結構的xyz文件 文/Sobereva@北京科音 First release: 2019-Apr-26  Last update: 2023-Jun-14 xyz是一種非常常用的記錄化學體系結構的文件格式，定義極其簡單。筆者開發的好多程序，以及其它計算化學程序經常涉及這個格式，網上老有初學者問這文件怎么回事、怎么產生，遂在這里統一介紹一下。 1 xyz文件的定義 xyz是文本型文件，可以...