• [置頂] 近期北京科音舉辦的計算化學類培訓班的通知及未來培訓的預告

    北京科音自然科學研究中心(http://www.keinsci.com)從2015年起舉辦的各種計算化學培訓班以極高的含金量和良心的收費而著稱,深受歷屆學員好評,在計算化學領域內有非常高的知名度和關注度,歡迎進入http://bbs.keinsci.com/forum-43-1.html查看歷屆培訓回顧和學員參后感想! 以下是北京科音近期舉辦的培訓以及未來要舉辦的培訓的預告。培訓地點皆為北京,全部由Sobereva講授。不方便到現場參加,或者等不及參加下一屆培訓者...

    計算化學研究者應當了解的文件壓縮的常識

    計算化學研究者應當了解的文件壓縮的常識 文/Sobereva@北京科音 First release: 2023-Jun-10    Last update: 2023-Jun-11 0 前言 筆者每天在網上回答各種計算化學問題時,經常看到有計算化學研究者對文件壓縮真是毫無概念。比如分享好幾百兆甚至1GB以上的fch、cub文件時居然都不壓縮!又浪費自己上傳文件的時間,又浪費他人下載文件的時間,還浪費...

    使用Multiwfn結合CP2K的波函數模擬周期性體系的隧道掃描顯微鏡(STM)圖像

    使用Multiwfn結合CP2K的波函數模擬周期性體系的隧道掃描顯微鏡(STM)圖像 文/Sobereva@北京科音    2023-Jun-4 1 前言 強大的波函數分析程序Multiwfn(http://www.shanxitv.org/multiwfn)有非常方便好用的模擬隧道掃描顯微鏡(STM)圖像的功能,模擬的原理以及Multiwfn中此功能的用法我在《使用Multiwfn模擬掃描隧道顯微鏡(STM)圖像》...

    基于Gaussian的NMR=CSGT任務得到各個軌道對NICS貢獻的方法

    基于Gaussian的NMR=CSGT任務得到各個軌道對NICS貢獻的方法 文/Sobereva@北京科音   2023-Jun-3 1 前言 NICS是最流行的考察芳香性的方法之一,《衡量芳香性的方法以及在Multiwfn中的計算》(http://www.shanxitv.org/176)中我做過介紹,如果不會算的話先仔細看此文。對于某些電子結構特殊的體系,比如18碳環(http://www.shanxitv.org/carbon_...

    2022年度完結動畫總評

    2022年度完結動畫總評 文/Sobereva  2023-Jun-2 此文對筆者完整看過的2022年度完結的72 部全長版TV動畫和6部泡面番進行總評,近19萬字。劇場版、OVA之類的都沒有納入其中,因為另有文章。此文只有“2023年1月完結”部分是新寫的,2022年4月、7月、10月完結的動畫的評論在作品剛完結之時就已經寫好并發在了筆者的blog上,在此文只是匯總而已(所以有些文字現在看起來已經out了),不過很多作品的總評分為了保持評...

    2022年10月完結動畫簡評

    2022年10月完結動畫簡評 文/Sobereva  2023-Jun-2 本文是筆者完整觀看過的2022年10月完結的20部全長TV版動畫的簡評。注意其中多多少少有一些劇透的成份,怕被劇透又想了解哪些值得追的話就看評分就好了。所有新番筆者都看過前幾話(2022年7月開播的番的掃番過程的粗略觀感在http://bbs.keinsci.com/thread-30762-1-1.html里寫了),沒追的要么是筆者對其題材有抗拒(比如恐怖或者過于...

    一篇最全面介紹各種弱相互作用可視化分析方法的文章已發表!

    一篇最全面介紹各種弱相互作用可視化分析方法的文章已發表! 文/Sobereva@北京科音  2023-May-31 弱相互作用研究是21世紀化學領域研究的重點和熱點之一。自從2010年楊偉濤等人于J. Am. Chem. Soc., 132, 6498 (2010)發表NCI(也稱RDG)弱相互作用可視化分析方法以來,弱相互作用的可視化分析迅速得到了非常廣泛的應用,已經是研究弱相互作用的標準方法之一。在此之后,各種弱相互作用可視化方法得到了...

    2023年4月完結動畫簡評

    2023年4月完結動畫簡評 文/Sobereva  2023-May-28 本文是筆者完整觀看過的2023年4月完結的27部全長或半長TV版動畫和2部泡面番的簡評,共5.9萬字。注意其中多多少少有一些劇透的成份,怕被劇透又想了解哪些值得追的話就看評分就好了。所有新番筆者都看過前幾話(2023年1月開播的番的掃番過程的粗略觀感在http://bbs.keinsci.com/thread-34561-1-1.html里寫了),沒追的要么是筆者對...

    CP2K中遇到SCF難收斂時的解決方法

    CP2K中遇到SCF難收斂時的解決方法 文/Sobereva@北京科音  2023-May-15 0 前言 經常有人問CP2K中遇到SCF難收斂怎么解決,這是很家常便飯的問題。這里就基于筆者講授的“北京科音CP2K第一性原理培訓班”(http://www.keinsci.com/workshop/KFP_content.html)里面相關部分的內容專門寫個博文,供CP2K用戶參考。這里假定讀者已經了解CP2K計算的基本的背景知識...

    不尋常的環[18]碳前驅體C18Br6的電子結構和芳香性

    注:本文是江蘇科技大學的劉澤玉、北京科音自然科學研究中心的盧天等人2023年在歐洲化學刊物發表的Electronic Structure and Aromaticity of an Unusual Cyclo[18]carbon Precursor, C18Br6, Chem. Eur. J., e202300348 (2023) https://doi.org/10.1002/chem.202300348一文的主要內容的譯文,本文章由劉澤玉翻譯和提供。歡迎在閱讀本文后進一步閱讀...

    使用了Multiwfn發表的第11001~12000篇文章打包下載

    下面是第11001~12000篇使用了筆者開發的功能非常全面而且在世界范圍流行的Multiwfn波函數分析程序(http://www.shanxitv.org/multiwfn)發表的文章的全文pdf合集(其中漏了幾篇文章對應的文件,不好找了)。 阿里網盤(速度很快。各個pdf單文件上傳):https://www.aliyundrive.com/s/uazRZnDwbJ1  提取碼: q36a 百度網盤下載地址(速度慢。所有pdf分卷壓縮):https...

    通過量子化學計算和Multiwfn程序預測化學物質的顏色

    通過量子化學計算和Multiwfn程序預測化學物質的顏色 文/Sobereva@北京科音   2023-Mar-26 1 前言 顏色無疑是化學物質極其重要的特征,理論預測化學物質的顏色對于從頭設計和改良化學物質有重要意義。通過量子化學計算可以模擬分子的UV-Vis光譜、通過第一性原理計算可以模擬固體和液體的UV-Vis譜,在原理上可以進而預測物質對應的顏色。一個很常見、很粗糙的預測顏色的方式是:在可見光波長范圍內(一般...

    使用Multiwfn計算分子的球形度(sphericity)

    使用Multiwfn計算分子的球形度(sphericity) 文/Sobereva@北京科音  2023-Mar-21 最近有人在計算化學公社論壇發帖問有沒有辦法度量一個分子的“球形度”,正好筆者開發的功能全面的波函數分析程序Multiwfn有現成的功能,這里就寫個小文介紹一下,并以度量正戊烷和新戊烷的球形度差異作為例子。Multiwfn可以在http://www.shanxitv.org/multiwfn免費下載,讀者必須使用2021-Mar-1...

    sobNEB:產生CP2K的NEB的插點的方便的工具

    sobNEB:產生CP2K的NEB的插點的方便的工具 文/Sobereva@北京科音  2023-Feb-28 1 介紹 CP2K有很好用的NEB功能可以得到反應路徑,靠CI-NEB還可以同時得到過渡態結構,用法在北京科音CP2K第一性原理計算培訓班(http://www.keinsci.com/workshop/KFP_content.html)里講得很詳細。雖然CP2K的NEB功能自己就能自動線性插點,但是偶有bug(有的初...

    巨幅減小Gaussian的TDDFT計算產生的fch文件的尺寸的方法

    巨幅減小Gaussian的TDDFT計算產生的fch文件的尺寸的方法 文/Sobereva@北京科音   2023-Feb-7 1 G16 C.01開始TDDFT的fch文件尺寸巨大的問題 Gaussian 16從C.01版開始,對大體系做TDDFT計算得到的chk轉換成的fch文件(Linux下默認為fchk后綴,是一碼事,本文不做區分)尺寸頗大,尤其是算的激發態數目多的時候。例如用Gaussian 16 C.02對...

    使用Multiwfn展現過剩電子(excess electron)并計算它的回轉半徑

    使用Multiwfn展現過剩電子(excess electron)并計算它的回轉半徑 文/Sobereva@北京科音   2023-Jan-30 1 過剩電子的展現 化學領域里的過剩電子(excess electron)通常是指定有電子比較集中地出現在化學體系的某一塊區域。過剩電子沒有唯一展現方式,有很多手段都可以展現其分布,比如電子密度差(參考《使用Multiwfn作電子密度差圖》http://sobereva.co...
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