MOPAC的安裝方法
MOPAC的安裝方法
文/Sobereva@北京科音
First release: 2014-Nov-21 Last update: 2022-Jul-20
0 前言
MOPAC的安裝極為簡單,自帶的說明已經寫得很清楚,但還是經常見到有初學者問,這里就再說說。不熟悉MOPAC的話先看看《大體系弱相互作用計算的解決之道》(http://www.shanxitv.org/214)里面的介紹。
先去http://openmopac.net/Download_MOPAC_Executable_Step2.html下載程序。Windows版就下載頁面上最新的即可。Linux版建議下載“Download 64-bit MOPAC2016 for LINUX”(不要下載Latest open-source release下面的Linux版,否則安裝時需要圖形庫,麻煩得很)。此頁面里還有GPU版,加速效果很有限,可以無視。
.mop后綴的文件是MOPAC的輸入文件,這里提供一個用PM6計算水分子的mop文件用于大家測試:http://www.shanxitv.org/attach/262/H2O.mop。
順帶一提,用Multiwfn(http://www.shanxitv.org/multiwfn)程序可以非常方便地創建MOPAC的輸入文件。啟動Multiwfn,載入xyz/pdb/gjf/fch/mol/mol2/mwfn等等含有結構信息的文件(詳情看《詳談Multiwfn支持的輸入文件類型、產生方法以及相互轉換》http://www.shanxitv.org/379),然后進入主功能100的子功能2,再選14,然后輸入要產生的MOPAC輸入文件路徑,再選一個理論方法如PM7,就得到輸入文件了,非常簡單。在選擇理論方法之前還可以用屏幕上的其它選項設置是否用溶劑模型、是否凍結原子、要做的任務之類。
1 Windows版MOPAC的安裝方法
運行Windows版.exe安裝文件,一直點下一步即可。所有設置,包括安裝目錄,都用默認的。
MOPAC在Windows下的使用方法:雙擊mop文件,操作系統如果問你選擇用什么程序執行,就選MOPAC。MOPAC算完后會自動關閉窗口(如果一瞬間就關閉了,說明一瞬間就算完了,不是出錯)。之后在當前目錄下會出現與mop文件同名的其它文件,其中帶.out后綴的就是輸出文件,用文本編輯器打開即可查看結果。.arc是archive文件,
在Windows下也可以用命令行方式運行。進入命令行模式,輸入MOPAC H2O.mop即可運行。
2 Linux版MOPAC2016安裝方法
比如想裝到/sob/MOPAC2016下面,就把壓縮包解壓到這里,然后在自己的用戶主目錄下的.bashrc文件末尾添加
export MOPAC_LICENSE=/sob/MOPAC2016
export PATH=$PATH:/sob/MOPAC2016
export LD_LIBRARY_PATH=$LD_LIBRARY_PATH:/sob/MOPAC2016
之后重新進入終端使上述環境變量設置生效。然后運行chmod +x /sob/MOPAC2016/*給此目錄下面的文件都加上可執行權限。
MOPAC在Linux下的使用方法:比如要就是yohane.mop,就輸入MOPAC2016.exe yohane.mop。會在同目錄下得到.out、.arc等文件。