PS：本文圖很多，110多張，34MB，請非常耐心地等待加載！ 2018年末在大阪、京都采風時的與二次元相關的見聞 文/Sobereva  2019-Feb-18 2018年年末去大阪及附近呆了10來天，購入的與二次元相關物在《2018年末在大阪入的二次元相關物品》（http://www.shanxitv.org/465）里進行了完整展示。此文里我把在這期間看到的與二次元有關的事物簡單聊聊。途中照片總共照了800張左右，不可能在這里...

PS: 本文圖非常多，90多張，24MB，請非常耐心等待加載... 2018年末在大阪入的二次元相關物品 文/Sobereva   2019-Feb-18 2018年12月去了趟大阪和附近地區，其中與二次元有關的記錄見《2018年末在大阪、京都采風時的與二次元相關的見聞（http://www.shanxitv.org/466）。此文把這次途中購入的二次元相關物展示一下。這是所有購入的物品匯總。下面挨個依次說說（PS：屋內...

DFT-D4色散校正的簡介與使用 文/Sobereva@北京科音 First release: 2019-Feb-13  Last update: 2019-Aug-10 之前筆者在《DFT-D色散校正的使用》（http://www.shanxitv.org/210）中詳細介紹了DFT-D3的函數形式以及使用方法，還有其它相關的文章：《亂談DFT-D》（http://www.shanxitv.org/83）、《談談“計算時是否需要加DFT-D...

量子化學程序Dalton的編譯方法和運行方式簡介 文/Sobereva@北京科音  2019-Feb-11 開源免費的量子化學程序Dalton（http://daltonprogram.org）雖然用起來比較復雜，對新手很不友好，但由于其擅長計算響應性質，是其它程序難以取代的，所以它有著獨特的地位。本文介紹怎么安裝Dalton，也簡單介紹一下怎么運行。本文說的Dalton都指的是Dalton suite中1983年開始發展的那個Dalton...

使用ORCA在TDDFT下計算旋軌耦合矩陣元和繪制旋軌耦合校正的UV-Vis光譜 文/Sobereva@北京科音 First release: 2019-Feb-10  Last update: 2021-Jul-10 1 前言 看本文前，強烈建議先看《使用Gaussian+PySOC在TDDFT下計算旋軌耦合矩陣元》（http://www.shanxitv.org/411）了解一些旋軌耦合矩陣元計算的基本知識，以及看《G...

使用Multiwfn計算CVB指數考察氫鍵強度 文/Sobereva@北京科音  First release: 2019-Feb-5  Last update: 2019-Feb-6 摘要：本文介紹基于電子定域化函數(ELF)定義的用于衡量氫鍵強度的CVB指數，并且演示怎么在Multiwfn程序（http://www.shanxitv.org/multiwfn）中計算。掌握這個方法，在討論氫鍵問題的時候相當于多了一個很有用的...

簡談Gaussian里找過渡態的關鍵詞opt=TS和QST2、3 文/Sobereva@北京科音  2019-Feb-3 Gaussian里找過渡態的關鍵詞有三：opt=TS、opt=QST2、opt=QST3。經常在網上看到有很多初學者居然把QST2當做找過渡態默認用的關鍵詞，明顯是被一些坑爹言教程毒害的后果。這里就抽一點時間非常簡單地說說常用的opt=TS關鍵詞，以及為什么我很不建議在一般情況下用QST2、QST3。本文并不舉實際計算例...

2018年下半年優秀動畫音樂推薦 文/Sobereva  2019-Jan-7 這是第9次寫“優秀動畫音樂推薦”系列文章，此系列從2014年起不斷發布，致力于盡自己微薄之力，令最杰出、最美妙的音樂能有出頭之地，而不被數目是它們20倍以上的海量的平庸、湊數的音樂埋沒。之前的動畫音樂推薦見 《2018年上半年優秀動畫音樂推薦》（http://www.shanxitv.org/428） 《2017年下半年優秀動畫音樂推薦》（http://sobereva...

GROMACS的原生Windows版的編譯和安裝方法（支持GPU加速） 文/Sobereva@北京科音   First release: 2019-Jun-4  Last update: 2021-Jul-10 注1：本文拿2019.1版作為例子進行說明編譯過程。本文的純CPU版的編譯方法經測試對于GROMACS 2018、2019各版本都適用，其它版本只要不是太老的應當都可以用，但未經實際測試。本文的編譯CUDA GP...

注：GROMACS通常在Linux下運行，本文只講在Linux下的編譯和安裝方法。GROMACS在Windows下也照樣可以完美編譯和運行，參見《GROMACS的原生Windows版的編譯和安裝方法》（http://www.shanxitv.org/458），里面還提供了筆者編譯好的Windows版。 GROMACS的安裝方法 文/Sobereva@北京科音 First release: 2019-Jan-2  Last up...

2018年下半年觀看的非TV版動畫簡評 文/Sobereva  2019-Jan-1 以前Sobereva只寫觀看了的TV版動畫評論，但是我看的OVA、OAD、SP、劇場版等額外形式的動畫也不少，不寫評論可惜了，因此這里對從2018年9月15日開始截止到2018年12月31日觀看的非TV版動畫也都進行簡單評論，以后也會一直寫此類評論。還有些此類動畫看完后忘寫了，就也不再補了。由于這類動畫不好對比和打分，我也就不給出評分了。 牽...

VASP的最簡單的安裝方法 文/Sobereva@北京科音   2019-Jan-1 目前計算化學公社論壇（http://bbs.keinsci.com）上的第一性原理板塊里已經有多篇寫得很好的關于VASP的編譯方法的帖子了。筆者這里寫一個初學者最易于理解的版本，不僅所需要的操作步驟是最少的，而且編譯出來的VASP運行效率幾乎是最高的。考慮到少數讀者可能存在閱讀理解能力障礙、極其不情愿看文字，本文的安裝過程筆者錄了完整的演示視頻，...

視頻地址：https://www.bilibili.com/video/av39555524/  因為給別人解釋怎么安裝計算化學程序的時候，對方有極大概率是Linux零基礎，不知道系統怎么裝，或者裝了也是瞎裝，故錄此視頻。完全Linux零基礎的人嚴格照著此視頻也可以順利安裝最適合計算化學工作者使用的CentOS。本視頻雖然用的是VMware裝的，但對于實體計算機，只要把鏡像燒到U盤或光盤并由其啟動，之后的安裝過程和視頻里完全一樣，只不過應在安裝界面里根據實際情況對硬盤進行分區。筆...

使用CYLview繪制高質量分子結構圖和制作化學反應演示動畫 文/Sobereva@北京科音 2018-Dec-26 CYLview的雖然功能不算多強大，但它在作圖的很多特性方面沒有其它程序能很好取代，所以筆者特意錄制了長為11分鐘的使用CYLview繪制分子結構圖和制作各種類型動畫的演示視頻，見：https://www.bilibili.com/video/av39041185 本文內容是對視頻內容進行一些補充說明。視頻里并...

Multiwfn FAQ 文/Sobereva@北京科音  First release: 2018-Dec-24   Last update:  2023-Apr-25 波函數分析程序Multiwfn（http://www.shanxitv.org/multiwfn）如今已十分流行，本文針對用戶常問的問題進行統一解答，也推薦所有Multiwfn用戶完整閱讀此文！此文會經常更新。本文分為四部分：(1)常識性...