將Gaussian的IRC任務輸出轉換為.xyz軌跡文件的工具：GauIRC2xyz

將Gaussian的IRC任務輸出轉換為.xyz軌跡文件的工具：GauIRC2xyz

文/Sobereva @北京科音

 First release: 2015-Mar  Last update: 2022-Dec-7

以前有人問諸如怎么得到Gaussian產生的IRC每個點的結構、怎么得到IRC中某個幾何變量的變化。于是抽空寫了這個程序解決此問題。

GauIRC2xyz最新版下載地址：http://www.shanxitv.org/soft/GauIRC2xyz_1.2.7.zip。其中帶.exe后綴的是Windows版可執行文件，無后綴的是Linux下的可執行文件。

此程序用于將Gaussian的IRC任務的輸出文件轉換為同目錄下同名的.xyz軌跡文件。啟動后輸入文件名即可。trimerization.out是示例輸入文件，trimerization.xyz是轉換出來的軌跡。

.xyz軌跡格式很簡單，見《談談記錄化學體系結構的xyz文件》（http://www.shanxitv.org/477）。很多程序都可以支持.xyz軌跡文件，比如VMD，它使得分析IRC過程中各個變量的變化很方便。比如想看IRC中某個鍵長度的變化，將.xyz軌跡文件載入VMD，然后按鍵盤上的2，點擊相應兩個原子，然后進Graphics - Labels，下拉框選Bonds，選中相應的項，選 Graph標簽頁，點Save即可將軌跡中這兩個原子間距離保存到指定的文本文件中。