使用Molclus結合xtb做的動力學模擬對瑞德西韋(Remdesivir)做構象搜索

懶得在這里再發一遍了，本文直接在計算化學公社論壇看： http://bbs.keinsci.com/thread-16255-1-1.html

此文目的是介紹怎么用molclus基于xtb做的分子動力學軌跡作為初始構型，搜索治療武漢肺炎的特效藥瑞德西韋的在水溶液下的能量最低構象，最終結果如下。此文的做法是對較大體系構象搜索的極佳、普適做法。

后注：鑒于有人在病毒名稱上特別敏感，筆者在此進行如下專門澄清，以后不要再試圖給筆者發郵件在肺炎的用詞方面找茬
2020年1月下旬，肺炎在武漢大規模爆發之后，中國的媒體、網絡上基本都使用wuhan肺炎作為此病的稱呼。本文是2020年2月8日早上發布的。在2020年2月8日下午，有關部門才將此病命名為新冠肺炎。之后在2020-Feb-11的時候，WHO才正式宣布了此肺炎的名稱為COVID-19，見https://www.who.int/emergencies/diseases/novel-coronavirus-2019/technical-guidance/naming-the-coronavirus-disease-(covid-2019)-and-the-virus-that-causes-it。因此本文的用詞沒有任何不當。