VMD的APBS插件提示...unreadable的解決方法

VMD的APBS插件提示...unreadable的解決方法

文/Sobereva   寫于約2008年

這個插件是有bug的，mailing list也有報告，但是沒給出解決方法。

實際上這個問題是由于APBS插件寫入apbs.in里面的pqr文件路徑有誤導致的。

雖然偶爾莫名其妙地通過改臨時文件路徑解決了，但大多數情況并不奏效

解決方法是：

照常操作，點擊Run之后出現...unreadable

然后進入生成的臨時文件夾，比如c:\apbs.27460，修改apbs.in里面mol pqr后面的pqr路徑成為正確路徑

然后進入dos提示符，進入此目錄，手動運行apbs apbs.in             //之前把apbs.exe路徑加入系統-高級-環境變量-PATH環境變量中

在此目錄下得到.dx文件，根據任務不同，文件名會不同

進入VMD載入pqr文件，再把這個.dx文件加載進此分子ID中，就行了，然后該干什么干什么。

PS:實際上也可以改apbsrun.tcl，就是麻煩點，有興趣者不妨嘗試。