GauMD2xyz：將Gaussian的從頭算動力學軌跡轉換為xyz軌跡的程序

GauMD2xyz：將Gaussian的從頭算動力學軌跡轉換為xyz軌跡的程序

文/Sobereva@北京科音   2020-Apr-5

最新版本：1.2
下載地址：http://www.shanxitv.org/soft/GauMD2xyz_1.2.zip
其中帶.exe的是Windows版可執行文件，無后綴的是Linux版可執行文件。

簡介：
此程序用來將Gaussian的BOMD或ADMP任務產生的軌跡轉化為多幀.xyz格式（格式介紹見http://www.shanxitv.org/477），以便被動力學可視化程序如VMD所進一步分析。

首先在Gaussian中執行BOMD或ADMP任務。之后啟動本程序，輸入fch/fchk文件名或者Gaussian輸出文件名（必須以.out或.log為后綴），然后輸入要產生的.xyz文件路徑即可。文件包里有個test目錄，里面包含了一些例子。

如果BOMD任務的ntraj設為了大于1，即計算多條軌跡，本程序還會提示用戶選擇要讀入哪條軌跡。